Jūros aplinka – okeanografiniai, hidrologiniai, hidrografiniai, geologiniai, biologiniai, ekologiniai jūros ir kranto zonos tyrimai;
Jūrinės technologijos – jūrinių ir kranto mechaninių ir mechatroninių sistemų dinamikos tyrimai; jūrinių konstrukcijų ir jų medžiagų tyrimai; žmogiškųjų faktorių ir technologinių sistemų bei bioinžinerinių priemonių tyrimai; intelektinių transporto sistemų valdymo technologijų kūrimas; laivybos uostų, laivų pramonės, jūrų verslų ir jūrinės energetikos technologijų ir įrenginių tyrimai; laivų hidrodinamikos, mechanikos, energetikos ir aplinkosaugos technologijų, sistemų ir įrenginių tyrimai.
Regiono darnus vystymas - ekologinės ir kranto zonos problemos, uostų vystymas, jūros ir kranto zonos išteklių įsisavinimas, turizmo plėtra, jūrinių teritorijų planavimas, integruotas kranto zonos valdymas.
